・脚本集にも書いていたが、暴走した時の零号機は実は自分の頭をもぎ取ろうとしている 【493】

引用:新世紀エヴァンゲリオン絵コンテ集〈1〉富士見書房
・脚本と一緒でこの段階でもプロトエヴァンゲリオン零号機(フィルムではエヴァンゲリオン試作0号機) 【505】
・使徒解析プレハブでゲンドウを見ているシンジ。「自分に気づきもせず素通りしてあんなものに熱中している父親に不満」、「どうせボクなんか・・・の表情で目をそらしひっこみかけるが、やけどの跡を見つける」とのコメント 【515】

引用:新世紀エヴァンゲリオン絵コンテ集〈1〉富士見書房

引用:新世紀エヴァンゲリオン絵コンテ集〈1〉富士見書房
・ゲンドウのやけどについて説明するときのリツコ(「おもむろにやさしげに」)のコメントあり 【519】
・カレーをラーメンに入れるミサトさん(「本気である」)とのコメント(ミサトさんはある程度人の目を気にして明るくふるまっている人物である) 【534】
・リツコ「いい子よとても」 リツコさんが笑顔なのは自分の気持ちを悟られないため【545】

引用:新世紀エヴァンゲリオン絵コンテ集〈1〉富士見書房
・リツコ「生きることが」 口元は笑っているが目はさびしくとのコメント 【545】

・550ページに綾波の部屋の間取りが描いてある 【550】
・部屋でシンジを発見する綾波(「レイも少し驚いたか・・・」)とのコメントあり 【554】
・シンジと綾波がこけたときにかかる虹(「美しく! 加藤様江何とぞよろしく」)とのコメントあり【559】
・綾波が体を起こすところ(「見えそうで見えないアングルで ムリ?」)とのコメント 【563】
・眼鏡を見る綾波のカット(「恋するような微笑みを見せるレイ 」)とのコメントあり 【568】
・脚本では外を歩く綾波の髪はまだ濡れていたが、コンテでは「まだ湿っている」ぐらいのレベル 【570】
・コンテの段階でもシンジからカードを取る時の綾波は「奪うように取っていく」と書かれている 【572】
・シンジをビンタした綾波。踵を返すときに「こっち向きに戻るか・・・フツウ・・」とコメントアリ(どっち側から踵を返すかについてコンテを描いている甚目さんが考えているっぽい) 【577】
・零号機の起動実験(「血が血管を流れるイメージを音で表現できないか? 心音でなく・・・」) とのコメントアリ 【580】
・零号機が起動したことを綾波は当たり前のことだと思っている 【585】

引用:新世紀エヴァンゲリオン絵コンテ集〈1〉富士見書房
・この段階では射出口で出撃時に左手にポジトロンライフルを持っている初号機 【591】

引用:新世紀エヴァンゲリオン絵コンテ集〈1〉富士見書房
・コンテ完成日 94年 12月7日【596】