新世紀エヴァンゲリオン絵コンテ集〈4〉 より
・脚本にも書いてあるが玄関にあるミサトさんの荷物は5日分の衣服 (「女の人の5日分の着替えってのは相当な量だと思う」) と書いてある 【216】
・夫婦喧嘩発言の時にアスカが一瞬トウジをキッと見るカット。 トウジはそれを見て「こいつ知っとんのか・・・」と思っている(コンテ見ないと分かりづらい) 【224】
・トウジ「そうや」 (「こんな場面でこんな笑い方をするやつはもう長くはないなという笑い」)とある(そんなこと思ってたのかトウジ) 【229】

・アスカ「そう!」 (「どこからくるんだその自信はというぐらい自信満々な笑顔」)とある 【237】
・そのアスカを見て笑ってしまう委員長の顔 (「なんじゃこの絵は~!! ちがう~!」 というコメントに ←「よ.ろ.し.く.」)という庵野さんのコメント 【237】

・アスカ「加持さんお風呂長いのね」のあと (「なぜアスカがつれないのか分からないシンジ」) とある 【240】
・「知らない」の前のアスカ (「ミサトも言わないことをなぜ私が」)と思っている 【241】
・シンジ「ミサトさんともですか?」 加持さん (意外とマセた反撃に「おっ」となる) とある 【246】

・ミサト「その気になれば世界を滅ぼせるわね」のとこ リツコを見てちょっとカマをかけているミサト(エヴァの存在に疑問点を持っているので) とある 【249】
・ヒカリ「まだ来てないよね、アスカ」のときアスカは「なんだっけ…」 「あ、なんだトウジのことか」 と思っている 【252】

・3号機の目 目に血管ありとなっている(つまりこの段階での意図的なもの) 【254】
・珍しくAパート終わった時に (「やっとAパートEND! やっと#18! もう#6のOAが済!?」) とある 【258】

引用:新世紀エヴァンゲリオン絵コンテ集〈3〉富士見書房
・シンジ「でも使徒相手に僕らだけで」の時のシンジ (「ミサトがいないというだけで心配になるシンジ(無意識に頼りきってる)」)とある 【262】
・零号機に向かって飛ぶ3号機 地面を蹴らずに浮遊している 【272】
・ダミー初号機の反撃 (「互いに首を絞め合う異様な場景!」) とある 【295】
・3号機パンチの後に 思わず目を覆う伊吹 「吐くのは#19にまかせたっす」 と書いてある 【301】

・ヒカリ「明日は食べてくれるかなぁ」 (このシーン趣味としては入れたいんすけど浮いてますねえ・・・う~ん)とある(入れて正解だったと思う) 【311】

引用:新世紀エヴァンゲリオン絵コンテ集〈3〉富士見書房
・シンジ「ミサトさん、無事だったんですね」で(「ミサトの安否などすでに頭の中で小さくなっているシンジ」)とある(ちなみにここは脚本決定稿では「ミサトさん!よかった無事だったんですね」となっており少しテンションが違う) 【315】
・脚本と同じく最後のシンジの「うわああああああ」なし
最後はシンジの心臓の音がドクンドクンと聞こえる→シンジの瞳孔が閉まる(ここはフィルム通り)となっている なお瞳孔のとこで「う~んありきたりー」とのコメントあり 【317】

引用:新世紀エヴァンゲリオン絵コンテ集〈3〉富士見書房
・コンテ完成日 95年11月15日 (「#18END!! いろいろと申し訳ありません・・・#7 O.Aの日・・・」)と庵野さんのコメントあり 【317】

引用:新世紀エヴァンゲリオン絵コンテ集〈3〉富士見書房