・サブタイ前のリツコが水流しっぱなしにしてるとこ 『広い洗面所』(「早い話がトイレか?せめてマルイのトイレぐらいの〇〇〇(読めない)で貧乏くさくしないでよろしく」) と庵野さんのコメあり 【384】
・(「Q発令所のバンクある? Aあるッス 1話のでよろしく 」)とある コンテの岡村さんと庵野さんのコメントのキャッチボール 【395】

引用:新世紀エヴァンゲリオン絵コンテ集〈3〉富士見書房
・壁に腐食(イロウル)があるシーン 「不気味な音楽を入れようか…」みたいなことが書いてあるが 庵野さんが「すみません。入れないとおもい☑ おそらく。」 と書いてある 【397】

引用:新世紀エヴァンゲリオン絵コンテ集〈3〉富士見書房
・冬月「進化か」 リツコ「はい」のカット コンテ岡村さんが(「Q天井はどうなっているのだ? A天井はBGBANKです」(たぶん庵野さん) とのコメントあり 【447】

引用:新世紀エヴァンゲリオン絵コンテ集〈3〉富士見書房
・リツコ「私のミスから始まったことなのよ」 (「自分のミスが許せないタイプ」)と書いてある 【449】
・リツコ「約束は守るわ。」 (「自分自身への決意も有り」)とのコメント 【453】
・「碇のバカヤロー」 目立つラクガキ「碇のバカヤロー」と書いてある。 コンテ段階で出来たラクガキだった? 【456】

引用:新世紀エヴァンゲリオン絵コンテ集〈3〉富士見書房
・ミサト「ねぇ、少しは教えてよマギのこと」の時の膝を抱える。ミサト (「コレかわいいのでできるだけ入れてみてください」)との庵野さんのコメント 【460】
(スキゾ等でも言ってるが庵野さんはミサトさんに思い入れを持っているとのこと)

引用:新世紀エヴァンゲリオン絵コンテ集〈3〉富士見書房
・カスパーの脳みそ 岡村さん(「液体とか出てきそうだけど出たら細胞死にそうな気がするなぁ…やめときましょう」) 庵野さん「そうっすね」コメント 【464】

引用:新世紀エヴァンゲリオン絵コンテ集〈3〉富士見書房
・リツコさんが脳みそに端子を差し込むところ、岡村さんが「脳みそ直接はやっぱりまずい気がしますんで小さなジャックがあるということで」 庵野さん「これでよろしく」とある。
(つまり脳みそに直接刺してるわけじゃなくて脳の中に小さなジャックがあり、そこに刺しているということが分かる(コンテ見ないと分かんねぇ…)) 【465】

引用:新世紀エヴァンゲリオン絵コンテ集〈3〉富士見書房
・リツコ「実はプログラムを微妙に変えてあるのよ」は脚本決定稿でもそうだったが「みんな同じだと思ってるけど、実はプログラムを微妙に変えてあるのよ」となっていた 【480】
・コンテ完成日 95年8月6日 (「やっと14#!! ヒロシマ50thの日・・・」) とのコメントあり(庵野さんかなぁ) 【482】

引用:新世紀エヴァンゲリオン絵コンテ集〈3〉富士見書房